Après les tragiques événements du 11 septembre 2001, Terry Allen, un comptable fraîchement licencié, sombre dans la paranoïa la plus totale, allant jusqu'à soupçonner la présence de terroristes islamistes dans son voisinage.
Zane Zaminsky, radioastronome, sonde les fréquences aériennes afin de déceler la preuve d'une éxistence extraterrestre. Un jour, il entend des cris aigus sortant de ses enceintes. Il s'agit d'une onde de choc provenant d'au-delà de notre système solaire, une preuve plausible de la vie extraterrestre. Son enquête le conduit au Mexique où il decouvre une base secrète habitée par des extraterrestres. Sous leur apparence humaine se cache une tout autre réalité.